Nagroda im. Adama Mickiewicza, 2009
W roku 2009 Freya von Moltke otrzymała nagrodę im. Adama Mickiewicza za zasługi na rzecz "urzeczywistniania ideałów pojednania i porozumienia między narodami Europy". Wyróżnienie odebrał jej syn, Helmuth Caspar von Moltke. Wraz z Freyą von Moltke nagrodę otrzymali francuski działacz ruchu uporu Stéphane Hessel oraz dr Zdzisław Najder, założyciel Polskiego Porozumienia Niepodległościowego i doradca Solidarności.
Nagroda przyznawana jest od roku 2006 przez przewodniczącego Komitetu na rzecz Wspierania Współpracy Polsko-Niemiecko-Francuskiej, Klausa-Heinricha Standke, oraz Burmistrza Miasta Weimar, Stefana Wolfa. Pierwszymi wyróżnionymi byli ojcowie założyciele Trójkąta Weimarskiego, ówcześni ministrowie spraw zagranicznych Hans-Dietrich Genscher, Roland Dumas i Krzysztof Skubiszewski.
Nagroda Kulturalna Śląska Kraju Związkowego Dolnej Saksonii, 2009
24 października 2009 w Brunszwiku przyznano Nagrody Kulturalne Śląska Kraju Związkowego Dolnej Saksonii. Wśród wyróżnionych znalazły się Fundacja Krzyżowa dla Porozumienia Europejskiego oraz Fundacja im. Freyi von Moltke. Jury renomowanej nagrody doceniło tym samym międzynarodową pracę z młodzieżą oraz zaangażowanie tych, którzy ją wspierają.
Nagroda ta przyznawana jest od 1977 r. przyznawana jest co roku dwóm osobistościom, które zasłużyły się dla rozwoju kultury na Śląsku. Instytucjom przyczyniającym się w ten sposób przyznawana jest nagroda specjalna. Odebrała ją dyrektor Fundacji Agnieszka von Zanthier. W podziękowaniu powiedziała: „Jako Fundacja cieszymy się, iż wkład owej części społeczeństwa obywatelskiego, która w ciągu ostatnich 20 lat troszczyła się o Krzyżową, został dziś symbolicznie uhonorowany. Bez aktywnie zaangażowanych ludzi w Polsce i Niemczech nie byłoby dziś Nowej Krzyżowej.“